Neskorá jeseň je najlepší čas na vápnenie substrátu. Na stromoch zvyčajne nie sú žiadne listy, takže minimalizujeme riziko poškodenia rastlín vápnikovým hnojivom, ktoré by ich mohlo spáliť. Substrát začneme vápniť za bezvetrného počasia. Ak je pH v záhrade veľmi nízke, môžeme použiť vápno v oxidickej forme.
Účinkuje rýchlo, ale dosť agresívne, preto je bezpečnejšie použiť uhličitanové vápno, ktoré pôdu neodkyslí tak rýchlo, ale je bezpečnejšie ju použiť, pretože sa dlho uvoľňuje vápnik. Stojí za zmienku, že náhle skoky v hodnote pH sú škodlivé pre rastliny aj pre mikroorganizmy.
Oveľa lepšou praxou je postupné odkyslenie pôdy. Namiesto hnojenia vysokými dávkami vápna každých pár rokov je bezpečnejšie hnojiť vápnom každé dva roky, ale v menších dávkach.
